陈根:奥密克戎,向强感染性突变进化

陈述根本 2022-02-23

传染病科学科普

825 字丨阅读本文需 2 分钟

文/陈根

RNA病毒“高变异重组性”决定其“善变”的特性。

新冠病毒正是一种“善变”的单链RNA病毒,稳定性差。当基因在复制过程中发生错误,RNA病毒缺乏修正错误的聚合酶,复制错误会保留下来,这使得病毒发生毒株改变。RNA病毒有时还会出现基因片段重组的情况,产生新的变异株,因为这些特征,新冠病毒特别容易发生突变。

经过多代突变的奥密克戎如今已经成为世界的优势突变株,造成世界范围内的大流行。由于奥密克戎的高传染性和低致病性,一些科研人员推测这可能预示疫情“终结的开始”。但也有专家指出,新的变异毒株可能随时会在世界各地出现,疫情发展趋势仍存在不确定性,因此更需要全球协作,密切监测。

对于病毒突变的预测显得尤为重要。现在,在《ACS传染病》和《化学信息与建模杂志》上的一份报告发现,根据一个人工智能(AI)模型,奥密克戎和其他变体正在演变为增加感染性和抗体逃离的病毒。

研究人员分析了来自COVID-19患者的近150万个SARS-CoV-2基因组序列。他们在受体结合域(RBD)中发现了683个独特的突变,RBD是SARS-CoV-2刺突蛋白附着在人类细胞表面的人类ACE2受体上的区域。

随后,研究人员们用了一个人工智能模型来预测这些突变如何影响RBD与ACE2的结合强度以及130个抗体结构,包括几个用作治疗的单克隆抗体。

研究小组发现,加强感染性的突变是病毒进化的驱动力,而在高度接种疫苗的人群中,使病毒逃避疫苗的突变成为主导。研究人员还预测,某些突变的组合具有大规模传播的高可能性。

在《化学信息与建模杂志》杂志的另一项研究中,研究人员用人工智能模型深入分析了奥密克戎变体的感染性、疫苗突破性和抗体抗性,包括该变体在刺突蛋白上异常多的突变如何影响RBD与ACE2和抗体的结合。

结果表明,奥密克戎的感染性是原始冠状病毒的10倍以上,比德尔塔(Delta)变体的感染性高2.8倍。此外,奥密克戎比德尔塔更有可能逃避目前的疫苗,而且据预测它将损害几种单克隆抗体疗法的疗效。

研究人员表示,这些预测中有许多已经被新出现的实验结果所验证,强调了开发新一代疫苗和单克隆抗体的重要性。面对“善变”的新冠病毒,我们仍旧需要更有效的疫苗,至少对于当前引起广泛传播的奥密克戎来说,只有真正加强了疫苗对人体的免疫效力,我们才有可能真正终结疫情。

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