苦逼生物博士的福音:Transcriptic建立机器人实验室,让你再也不用熬夜空等实验结果

36 Kr 2014-08-27

机器人生物技术

1359 字丨阅读本文需 3 分钟

  罗素曾这样总结:人的一生主要做两件事,一是改变物体的形状大小,二是指使别人那么干。但是的出现改变了这一状况,真正把人从一些简单繁复的工作中解放出来。生物技术公司Transcriptic建立实验室,使生物实验室程序化。

  当 Max Hodak 还是杜克大学一位学生时,他要做的作业就是研发机器人交互界面。当时,他是大名鼎鼎的神经元工程师 Miguel Nicolelis 实验室里的研究助手,Hodak 碰到两个少见的问题:第一,很多机器人有着异常复杂的反馈系统,包括靠机机器手臂的神经元信号去识别所碰到的物体。

  第二,程序的操作员都是猕猴。

  Hodak 的工作就是建立猕猴大脑和机器人之间的交互界面。猕猴要去想怎么操作这些机器来完成任务,它们能得到果汁作为奖赏。Nicolelis 实验室已经成功地利用猴子和老鼠,把嘈杂的脑电图信号转化为机器可以识别的命令。

  当 Hodak 自己在实验室做这些实验时,他发现自己还不如那些猴子。他说:“在生物实验室,你把所有时间就用于等待某个实验结果,这种感觉就是机器人”。

  一些大型生物技术公司已经建立了机器人实验室,让机器人去完成重复累人的工作。但是这套系统太昂贵了!而且这些机器人的程序不灵活,不能迅速转变为新的程序。

  2012 年 2 月,Hodak 在杜克大学创办了他的第二家公司 Transcriptic 来改善这种情况。这家位于 Menlo Park 的公司,设计了一系列机器人系统,由这套系统去完成实验室里一步一步的程序。Transcriptic 的终极梦想是,不需要人去完成绝大多数生物学实验。在 2013 年秋天,这家公司开始提供一些简单的服务,如老鼠标本的基因分型。直到这个夏天,他们才发布主打产品。7 月,他们发布了一款云计算的平台,顾客可以在线设计自己实验室的操作程序,再由 Transcriptic 的机器人去完成剩下的事情。

  除了 Transcriptic,也开始有其他一些公司,让生物学家把基础工作外包给机器人实验室。就在今年 7 月,位于 Menlo Park 的另一家实验室也提供类似的服务,开发了如免疫印迹等。

  但是 Transcriptic 的远景不在于只提供一个让机器人去操作的菜单。Hodak 希望能开放给任何复杂层次的用户。他们想到的办法是,创造出一套生命科学的“编程语言”,让实验室里的操作与计算机操作同步。Hodak 发现很多攻读博士的学生都希望逃避简单枯燥的实验室工作,而把精力集中于诠释和设计新的实验。事实上,Transcriptic 的很多早期客户就是来自于学校里的学生,包括有 UCD、斯坦福大学和哈佛的。

  今天,大多数用户把 Transcriptic 当作一个合同研究组织(CRO,专门承担临床实验的外包工作), 定制如抗体筛选或核酸萃取这样的一揽子服务。Hodak 说:“这就是市场思考的方式”,他计划在未来几个月内增加新的服务,包括组织培养这样的服务。

  Hodak 说:“如果你只是想外包一个试验出去,那已经有很多合同研究组织(CRO)可以做了。但是,如果给这项工作编程,那就创造出了新的可能性!通过这个编程系统,你可以收集一个试验里各种反应的数据,再给这些数据建模,从而可以预测你可选的各种参数。”通过记录已有的试验数据,就可以让云平台去选择最好的程序来运行。即使某个反应出错,也可以自动选择新的参数才试验。这样的话,就能创造出一个闭环的反馈循环,而不需要人的参与。

  这项服务不一定就能吸引到大多数生物学家,但是对于新兴的生物数学家和生物技术初创者,它能够直接把实验室里的程序与数据连接起来。目前 Transcriptic 已经吸引了一些没有实验室经历的计算机科学家,他们只想要测试他们的生物数学模型,而不需要进生物实验室。

  随着技术不断成熟,机器人实验室已经拥有一些超过传统 CRO 的机会。实验运行的精确度远远超过了人的操作,而且成本上也有优势。除了前期的资本投入在设备上,一个机器人实验室也更加简洁:Transcriptic 只有两名全职工程师,主要负责找出程序漏洞和转换新任务。Hodak 预测机器人实验室的数量会持续上升,而且“原来的 CRO 市场一直都是碎片化的,看不出谁会赢者通吃。”

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